Program .fasta adalah paket perangkat lunak penjajaran rangkaian protein dan DNA. Aslinya perangkat lunak ini di rancang untuk mencari kemiripan rangkaian protein.
Perangkat lunak ini memiliki berkas ekstensi seperti .fas, .fsa, mpfa, .fa, .fna atau .fasta. Dapat dilihat dengan program penampil DNA.